Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC164612.2-201ENSMUST00000215737 719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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