Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms