Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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