Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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