Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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