Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms