Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms