Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms