Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms