Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rpl28P41105 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms