Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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