Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxraP28700 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxraP28700 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxraP28700 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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