Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Hoxd10P28359 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hoxd10P28359 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hoxd10P28359 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd10P28359 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hoxd10P28359 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms