Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8P23463 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms