Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01666 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01666 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms