Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccl20O89093 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Ccl20O89093 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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