Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Bbip1J3QMK2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms