Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms