Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms