Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms