Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms