Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rabgef1Q9JM13 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms