Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Upk3aQ9JKX8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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