Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Asf1bQ9DAP7 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms