Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn22Q9D7U6 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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