Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddx28Q9CWT6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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