Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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Gm9955Q8CEJ8 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Drosha-207ENSMUST00000169061 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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Gm9955Q8CEJ8 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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Gm9955Q8CEJ8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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Gm9955Q8CEJ8 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm9955Q8CEJ8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms