Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp44Q8C2S0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp44Q8C2S0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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