Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Atg16l1Q8C0J2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg16l1Q8C0J2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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