Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Olfr555-201ENSMUST00000098220 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trim35Q8C006 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trim35Q8C006 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trim35Q8C006 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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