Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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