Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Atg9aQ68FE2 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg9aQ68FE2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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