Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Rnf149Q3U2C5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rnf149Q3U2C5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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