Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Perm1Q149B8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Perm1Q149B8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms