Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Med6-205ENSMUST00000161598 897 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms