Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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NfiaQ02780 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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