Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms