Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13P70217 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd13P70217 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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