Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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