Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Sh3bp1P55194 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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