Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms