Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Usp4P35123 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp4P35123 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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