Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms