Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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