Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
BgnP28653 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
BgnP28653 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
BgnP28653 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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