Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P20040 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P20040 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P20040 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P20040 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P20040 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P20040 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P20040 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P20040 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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P20040 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P20040 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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