Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
GzmbP04187 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms