Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms