Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vmn1r167G3UW71 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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