Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ssxb8B1AY40 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ssxb8B1AY40 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb8B1AY40 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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